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团队简介

上海交通大学模式识别与生物信息学研究组的研究重点是模式识别与人工智能基础理论算法及其在生物医学大数据建模中的应用,发展复杂问题驱动的新理论与算法,探索信息与生命学科交叉研究的新方法。

团队亮点

发展复杂问题驱动的新理论与算法,探索信息与生命学科交叉研究的新方法。

团队细分研究方向
模式识别与数据挖掘基础理论
模式识别与数据挖掘基础理论
生物医学大数据挖掘与建模
生物医学大数据挖掘与建模
蛋白质结构和功能预测
蛋白质结构和功能预测
生物复杂网络建模
生物复杂网络建模
生物图像信息学
生物图像信息学
团队研究成果汇总

已发表的学术 论文121篇。 【其中SCI论文: 121篇,EI论文0 篇】

已授权的专利:0项。【其中国际专利 0项,国内实用新型专利 0项】

已授权的软件著作权:2 项

已获批的项目:0个【其中国家级项目0 个、省部级项目0个、市区级项目 0个、企业合作项目 0 个】

成果实物图
团队动态
2013-04-15
TargetATPsite作为J Comput Chem 2013
2013-06-03
潘小勇获上海市优秀硕士学位论文
2013-07-04
樊永显通过博士学位论文答辩
2014-02-18
杨静通过硕士学位论文答辩
2014-04-15
张亚楠获上海市优秀硕士学位论文
2014-12-02
实验室(Shen-Group)在国际蛋白质结构预测竞赛CASP11中被评测为 Top 3 的RR相互作用预测算法
2015-05-15
尹江波获上海市优秀硕士学位论文

带头人介绍

沈红斌

教授、博导

研究方向:生物信息学;模式识别与数据挖掘

2007年毕业于上海交通大学自动化系获模式识别与智能系统专业博士学位, 后赴哈佛大学医学院从事博士后研究工作, 2008年回国后在上海交通大学工作, 历任副教授、特别研究员、教授,现为上海交通大学特聘教授。

带头人社会兼职

上海市自动化学会模式识别专委会主任 (2015-); 上海市计算机学会生物信息学专委会副主任 (2015-); 中国计算机学会人工智能与模式识别专业委员会委员 (2013-); 中国人工智能学会模式识别专委会委员 (2014-);

研究团队

姚莉秀

博士、副教授  固定成员

研究方向:模式识别、数据挖掘及其应用

杭州大学本科毕业,中科院冶金所博士毕业。主持承担国家自然科学基金项目“面向钢铁生产的数据挖掘和数据融合信息处理平台及应用”和教育部重点实验室基金项目。,其中第一作者4篇。

杨 旸

博士、讲师  固定成员

研究方向:

张翰进

博士生  固定成员

研究方向:

徐莹莹

博士生  固定成员

研究方向:

殷 曦

博士生  固定成员

研究方向:

荣誉/奖项

2008
上海市浦江人才
2012
国家自然科学基金优秀青年基金
2014
ESI 高被引科学家
2015
中组部青年拔尖人才

主办期刊

:Nature子期刊Nature Protocols
:tems Biology Journal (2009-present)
Journal of Biomedical Science and Engineering (2007-present) 编委
:担任Current Bioinformatics (2011)客座编委
:担任 Bioinformatics
Genome Biology 等30余个国内外期刊的审稿专家
:担任BIBE07、CCPR2009/2010等多个国际学术会议组委会成员

教学情况

本科教程
C++程序设计;生物特征与模式分析
教学荣誉
上海市研究生优秀成果(学位论文)指导教师

实验室概况

悬挂式“多功能设备供给舱”

性能参数:悬挂式多功能供给舱是专门为不同实验科目提供灵活供给而设计的产品。它与天花板上的工艺管道相联结,提供电力、数据、照明、电话、抽风、水道等中枢连接。其特点是高效,省地,方便。设备供给舱与水电气的管道有快速连接和断开的功能设计,可以应对不断变化的需求。配合供给舱的工作平台开始增加升降功能,最大限度地满足不断变化的实验类型和工作情况的不同需要。

操作人员: 分析人员:

收费标准: 0.0 元/次

联系人员:某某

合作企业

合作内容:将理论模型建设成了30个生物信息网站平台和计算工具,已累计提供在线计算和预测超过6百万次。 所提出的蛋白质结构预测方法(Shen-Group)在国际蛋白质结构预测竞赛CASP11中被评测为 Top 3 的RR相互作用预测算法。

合作成效:

科技服务

文献检索与分析 专利检索与分析 样品测试与分析 实验设计与操作 产学研联合开发 标准研制与咨询 共建研究中心 研究资源对接 企业资源对接 承办专业研讨会

合作需求

跨领域研究合作 中试/产业化合作 其他合作需求
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